آیت الله سید محمدمهدی میرباقری در سال ۱۳۴۰ در قم و در خانواده ای مذهبی دیده به جهان گشود و از آنجایی که علاقه وافری به علوم دینی داشتند وارد حوزه گردیدند.

از مهم‌ترین اساتید ایشان در فقه و اصول آیت الله جواد تبریزی، وحید خراسانی، زنجانی و سبحانی و در منطق و فلسفه آیت الله حسن‌زاده آملی، عبدالله جوادی آملی، محمدتقی مصباح یزدی و علامه سید منیرالدین حسینی الهاشمی را می‌توان نام برد.

آیت‌الله میرباقری از دوران نوجوانی تا کنون در عرصه‌های مختلف انقلاب و نظام اسلامی فعال بوده است. برخی از مهم‌ترین فعالیت‌های ایشان عبارتند از:
مبارزات انقلابی: شرکت در مبارزات علیه رژیم پهلوی و حضور در جبهه‌های جنگ تحمیلی.
فعالیت‌های فرهنگی: تأسیس و مدیریت فرهنگستان علوم اسلامی، عضویت در هیئت امنای مؤسسات انقلابی و مدارس علمیه.
فعالیت‌های سیاسی: شرکت در مناظرات و نشست‌های سیاسی، دفاع از مواضع انقلاب اسلامی، ارائه تحلیل‌های راهبردی در حوزه‌های مختلف سیاسی، فرهنگی و اجتماعی.
تدریس و پژوهش: تدریس در حوزه‌های علمیه، تألیف و انتشار آثار متعدد در زمینه‌های مختلف دینی و اجتماعی.
به طور خلاصه، آیت‌الله میرباقری یک روحانی انقلابی، پژوهشگر و فعال اجتماعی است که عمر خود را وقف خدمت به اسلام و انقلاب اسلامی کرده است. ایشان در طول سال‌ها فعالیت خود، نقش مهمی در تقویت بنیان‌های فکری و فرهنگی انقلاب اسلامی ایفا نموده‌اند.

مهم‌ترین حوزه‌های فعالیت ایشان عبارتند از:
فلسفه و کلام اسلامی
سیاست و حکومت اسلامی
تمدن‌سازی اسلامی
اخلاق و عرفان

به عبارت دیگر، آیت‌الله میرباقری یک شخصیت جامع‌الاطراف است که در حوزه‌های مختلف دینی و اجتماعی دارای نظرات و دیدگاه‌های ارزشمندی می‌باشد.